赤瓜岛的树木覆盖已形成森林，其自然生态环境与太平岛相媲美，尽管存在几处差异。

位于南沙群岛北部的九章群礁，赤瓜岛坐落于其最南端，控制着南华水道的入口。作为九章群礁的一部分，赤瓜岛东面距离美济岛公里，西侧至永暑岛为公里。赤瓜岛历史上的“3.14赤瓜礁海战”便在此地发生。

赤瓜岛拥有约11平方公里的礁盘面积和0.平方公里的陆地面积，虽然在南沙群岛中的面积排名第14，但其战略位置至关重要，不仅守护着南华水道的东西方向，也监视着九章群礁20余个岛屿和暗沙。

赤瓜岛礁盘

根据最新的卫星图片显示，赤瓜岛经历了多年的基础设施建设，岛上建筑物已基本完工。其棋盘式的绿化布局生机勃勃，从远处观看，灯塔和楼房顺序排列，树木高耸，仿佛一座海上新城镇。

南沙群岛处于热带地区，这里气候高温多湿，盐分浓度高，除了强烈的阳光和珊瑚礁之外，还经常遭遇猛烈的暴雨和台风。在这样的环境下，要使树苗在南沙岛礁上存活并不容易。尤其是新扩建的岛屿，由于进行了陆地吹填，主要由珊瑚沙石构成，高盐分环境并不适宜耐旱和盐碱性植物以外的树种生长。

赤瓜岛新城

南沙的天然岛屿，如太平岛、中业岛、北子岛、西月岛、南钥岛等，拥有较好的自然生态，岛上生长着茂盛的热带乔木，形成了广泛的海岸林，其中有些乔木高达30米。这些乔木主要包括檄树、榄仁树、莲叶桐、葛塔德木、草海桐、白水木等种类。其中较为高大的乔木有椰子、琼亚海棠、太平皮孙木、莲叶桐、榄仁树等。尤其是太平岛，其乔木连绵成林，形成了所谓的太平岛热带雨林。

赤瓜岛，经过陆地吹填而形成，从珊瑚礁上逐步扩展而来的陆地，以珊瑚沙石为主要土质，含盐量高，缺乏淡水资源。珊瑚沙石的颗粒较大，盐分浓度高，养分少，不利于普通植物的生长。尽管赤瓜岛经历了多个雨季的雨水冲刷，海盐成分

仍旧残留，在这种土质条件下，栽种树木需要挑选耐干旱及耐盐碱的品种，主要包括木麻黄、椰子树、麻枫桐、马尾葵、羊角树、棕榈树等，这些植物既能耐旱也能耐盐碱，并且具有固沙的能力。

航拍太平岛

树木的种植并不是简单地将其种下即可生长，首先需要从大陆运送营养土过来，挖坑种植，随后使用树木移栽生根液、大树吊袋液等，每日用淡水灌溉，这样90%以上的树苗可以成功生长。树木吊袋液主要是为了补充树木所需的各种营养成分，加速树木根系的愈合和生长，提升植物的免疫力，促进快速生根和发芽，避免枝干干枯或死亡。因此，南沙岛礁的树木成活率相对较高。

太平岛乔木

赤瓜岛的棋盘式树林和海岸防风林以木麻黄为主，该树种是南沙岛礁中罕见的高大乔木，最高可达30多米；其次是椰子树，能生长至20多米高。木麻黄，亦称马尾树，是一种常绿乔木，原生于澳大利亚和太平洋岛屿，中国南方和南海岛礁也有分布。由于其快速生长、强大的萌发能力、发达的根系以及耐旱、抗风沙、耐盐碱的特性，木麻黄成为热带海岸防风固沙的优良树种。

有观点提出，如果赤瓜岛的植被主要由木麻黄、椰子树、麻枫桐等组成，是否品种过于单一。相比之下，不远处的太平岛（两岛距离75公里），仅乔木就有20种，灌木16种，蔓性植物17种，草本植物53种，因而被誉为中国南海的植物博物馆。

太平岛植被

正如前文所述，两岛的地质结构和土壤条件有所不同，也与时间因素有关。尽管赤瓜岛和太平岛都是珊瑚岛，但太平岛为天然岛屿，拥有自然形成的淡水资源和丰富的植被，经过数百万年的自然演变，其植物种类繁多，根系发达。而赤瓜岛作为从珊瑚礁上扩展而来的人工岛屿，形成自然生态的历史较短。给赤瓜岛足够的时间，加上人工有序的管理，它终将发展成为一个像太平岛那样拥有丰富自然生态的岛屿，植物种类亦将逐渐增多。